Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms