Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFR3BQ9Y2G0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms