Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms