Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT6Q9ULM6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT6Q9ULM6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms