Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC23Q9UJX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms