Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms