Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms