Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CPNE7Q9UBL6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CPNE7Q9UBL6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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