Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REREQ9P2R6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms