Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms