Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms