Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms