Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms