Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT82Q9NSB4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms