Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms