Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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