Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms