Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFDQ9GZP0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDGFDQ9GZP0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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