Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms