Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms