Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms