Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms