Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms