Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms