Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRPF18Q99633 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRPF18Q99633 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRPF18Q99633 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRPF18Q99633 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRPF18Q99633 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRPF18Q99633 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRPF18Q99633 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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