Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms