Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms