Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX27Q96L92 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms