Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPTM1LQ96KA5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms