Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms