Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms