Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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