Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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UBE2E3Q969T4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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