Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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