Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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USP13Q92995 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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