Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTTNBP2Q8WZ74 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms