Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms