Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CHD5Q8TDI0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD5Q8TDI0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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