Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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