Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms