Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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