Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms