Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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