Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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