Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP50Q70EL3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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