Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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LINC00299Q6ZSB3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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LINC00299Q6ZSB3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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LINC00299Q6ZSB3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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LINC00299Q6ZSB3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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