Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms