Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms