Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms