Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GDF6Q6KF10 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms